Какие нибудь новые методы шифрования появились???

mrEDitor, заменится на квадратик. Уж лучше неразрывный пробел.

Можно ли закодировать m3g файл?

DaGGeR16, закодировать можно всё

Если речь идёт о шифровании данных то можно придумать свой алгоритм шифрования.
Я свой не дам(буду пользоваться).

Да вштваешь намертво в код ключ шифрования, которым расшифровываешь ресурсы. Что тут такого? Стоит попытаться изменить класс расшифровщика или попытаться узнать ключ, то ничего не получится. А если и получится то за нереальное количество времени.